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De nouveaux laboratoires pour explorer des voies de recherche inédites

Depuis de nombreuses années, le programme « Initiative G5 » permet à de jeunes chercheuses et chercheurs talentueux, venus du monde entier, de créer leurs propres laboratoires à l'Institut Pasteur, des Groupes à 5 ans. À l'issue du dernier appel à candidatures, international et très sélectif, quatre scientifiques de haut niveau ont intégré le programme G5. Trois d'entre eux viennent de démarrer leurs activités avec leurs équipes.

Des avancées scientifiques qui ouvrent de nouvelles perspectives

Les lauréats du programme G5 sont sélectionnés pour l'originalité, l'impact et l'ambition de leurs recherches. Devenus ainsi responsables de laboratoires, ils bénéficient d'importants moyens pour développer leurs projets pendant cinq ans, librement et à leur rythme. Des conditions favorables pour de futures découvertes majeures en matière de santé.

De la génétique au diagnostic de l’endométriose
Camille Berthelot, responsable du G5 Génomique fonctionnelle comparative
Généticienne spécialisée en bio-informatique, Camille Berthelot a créé son laboratoire G5 en 2021. Un véritable tournant dans son parcours qui lui a permis de développer des recherches sur l’évolution de la menstruation et ses liens éventuels avec l’endométriose.
Aude Bernheim
G5 Diversité moléculaire des microbes
Benoit Chassaing
G5 Interactions microbiote-hôte
Sebastian Baumgarten
G5 Biologie des ARN des parasites

Du G5 à l’unité de recherche : des parcours qui s’inscrivent dans la durée

L'aventure scientifique se poursuit au-delà du programme G5. La quasi-majorité des responsables de Groupes à 5 ans prennent la tête d'une unité de recherche à l'Institut Pasteur et poursuivent une carrière scientifique de premier plan.

Nicolás Rascovan,
Responsable de l’unité Paléogénomique microbienne.
Après cinq ans passés à la tête du G5 Paléogénomique microbienne, Nicolás Rascovan est devenu depuis peu responsable de l’unité de recherche du même nom. Biologiste passionné, il tente de reconstituer l’histoire génomique des humains et de leurs pathogènes pour révéler des dynamiques épidémiologiques sur plusieurs siècles.
Gérard Eberl
Responsable de l’Unité Microenvironnement et immunité.
Après avoir débuté sa carrière à l’Institut Pasteur à la tête d’un G5, Gérard Eberl dirige aujourd’hui l’unité Microenvironnement et immunité. Ses travaux ont notamment mis en lumière le rôle clé du microbiote dans l’équilibre des réponses immunitaires.
Initiative G5
En chiffres
90 %
des laboratoires G5 ont abouti à la création d'une unité de recherche
13
équipes G5 actuellement en activité à l’Institut Pasteur
(au 01/09/2026)
+
4
nouveaux laboratoires créés ces deux dernières années
38
responsables de G5 ont été lauréats d’au moins un prix scientifique

Laboratoire G5 : quel coût ?

Pour créer un laboratoire G5, l’investissement minimum de l’Institut Pasteur est de 1,6 million d’euros* (au total, sur cinq ans).

300 K€
environ
1 M€
300 K€
Coûts salariaux
(salaires + charges)
Ce montant correspond au salaire du responsable du G5, d’un post-doctorant et d’un technicien ou d’un ingénieur en bio-informatique.
Frais
d’équipements
Frais de fonctionnement
Budget + dotation annuelle de fonctionnement
11%
Taux de cofinancement des G5 en 2025
(part financée par des bailleurs externes, publics ou privés) – il était de 17 % en 2019 – la part restante des coûts, soit la quasi-totalité, étant financée par les ressources propres de l’Institut Pasteur.
* Budget moyen pour la création d’un G5, dépendant des équipements spécifiques à la thématique de recherche et de la séniorité du responsable.
Didier Mazel,
Directeur des carrières et de l'évaluation scientifiques.
« L’ambition de l’Institut Pasteur est d’offrir à des jeunes scientifiques les meilleures conditions pour réussir dans leur carrière et produire des travaux de grande qualité. Ce dispositif est un formidable levier pour dynamiser et pérenniser la recherche pasteurienne. »
Témoignage
Un tremplin idéal
« Le dispositif des G5 est un incubateur, non pas pour des start-ups, mais pour des laboratoires de recherche. Grâce au soutien reçu, j’ai pu recruter une solide équipe et utiliser des technologies de pointe pour décrypter les interactions entre les cellules immunitaires et le cerveau.Au final, nous avons eu l’opportunité de développer des idées nouvelles et nos données préliminaires sont très intéressantes. »
Aleksandra Deczkwoska,
Responsable du G5 Interactions cerveau-immunité
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G5 Immunité et infections des insectes
Sarah Merkling étudie la transmission des arbovirus par les moustiques
Sarah Merkling travaille depuis une dizaine d’années sur les interactions entre les moustiques et les virus, un domaine encore largement méconnu. Sa sélection parmi les derniers lauréats du programme G5 lui a donné la chance de pouvoir créer son laboratoire.

Après plusieurs mois d’installation, il est aujourd'hui 100 % opérationnel. La chercheuse travaille sur la transmission des arbovirus par les moustiques et son intuition est d’adopter une voie différente. Plutôt que de chercher à combattre directement le virus, Sarah Merkling veut comprendre ce qui se passe à l'intérieur du moustique Aedes aegypti, une espèce particulièrement active dans la transmission des virus Zika et de la dengue.

L’originalité des recherches de Sarah Merkling et de son équipe repose sur son approche « single cell » qui consiste à étudier un organisme cellule par cellule, une pratique peu courante pour les insectes. En effet, la chercheuse étudie l'estomac des moustiques (porte d'entrée des virus), afin de comprendre pourquoi certains d’entre eux permettent aux virus de se propager, tandis que d’autres sont capables de les combattre.

En identifiant les mécanismes naturels de transmission du virus chez les moustiques, l’objectif est de pouvoir mieux contrôler des épidémies, qui malheureusement vont s’intensifier avec le réchauffement climatique. L’une des pistes serait de modifier l’insecte afin qu’il ne puisse plus héberger le virus, interrompant ainsi sa transmission. Une autre voie serait de concevoir une nouvelle génération de vaccins qui permettraient à l’homme de développer des anticorps empêchant les moustiques de s’infecter au contact de personnes porteuses du virus.
G5 Neuroimmunologie et interactions materno‑fœtales
Morgane Thion étudie deux éléments clés pour protéger le cerveau en développement
Morgane Thion dirige le G5 Neuroimmunologie et interactions materno‑fœtales. Avec son équipe, elle cherche à comprendre comment le cerveau se construit et se protège avant même la naissance.

Pendant la grossesse, le cerveau et son réseau de vaisseaux sanguins se développent en parallèle. Deux acteurs jouent un rôle essentiel dans cette protection : les microglies, les cellules immunitaires qui résident dans le cerveau, et la barrière hémato‑encéphalique, qui contrôle ce qui peut passer du sang vers le cerveau.

L’équipe étudie le dialogue entre ces deux acteurs et la manière dont ils se coordonnent pour protéger le cerveau en développement. Elle cherche également à comprendre comment l’environnement maternel peut influencer ces étapes clés du développement cérébral.

Ces recherches fondamentales sont essentielles pour comprendre comment se construit un cerveau sain et permettront aussi, à plus long terme, de mieux comprendre ce qui peut perturber ces mécanismes précoces et contribuer à certaines maladies du cerveau.
Découvrez le tout nouveau laboratoire G5 de Morgane Thion.
G5 Évolution et conception des antigènes
Spyros Lytras utilise l’IA pour identifier de nouvelles cibles vaccinales
Virologiste de formation et responsable du G5 Évolution et conception des antigènes, Spyros Lytras développe un modèle innovant fondé sur l’intelligence artificielle pour concevoir de meilleurs vaccins.

Les protéines présentes à la surface des agents pathogènes sont reconnues par le système immunitaire, mais elles peuvent se modifier pour échapper à l’immunité acquise. En décodant leur « langage », l’IA permettra de prédire quelles parties de ces protéines sont susceptibles d’évoluer.

En étudiant à la fois leur séquence et leur structure en trois dimensions, Spyros Lytras espère identifier de nouvelles cibles vaccinales. À terme, ces travaux pourraient conduire à des vaccins offrant une protection plus large et plus durable contre de nouveaux agents pathogènes ou leurs futurs variants.
Le quatrième chercheur recruté à l'issue de la dernière sélection est Nader Yatim ; il dirigera le Groupe à 5 ans Biologie myéloïde pour le vieillissement et la maladie. Ses recherches débuteront dans le courant du 1er trimestre 2027.
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G5 Génomique fonctionnelle comparative
Camille Berthelot cherche à comprendre les origines de l'endométriose
Camille Berthelot étudie l’évolution de la menstruation chez les primates pour comprendre quel lien cette dernière pourrait avoir avec l’endométriose, une maladie gynécologique chronique très peu documentée, qui touche pourtant une femme sur dix.

Avec son laboratoire G5 Génomique fonctionnelle comparative, la chercheuse s’est lancée dans une recherche scientifique hors normes. Pendant près de trois ans, elle a collecté des échantillons rares : des tissus utérins de primates et d’humains, obtenus grâce à des collaborations avec des centres de primatologie et des hôpitaux. Son objectif est de comprendre pourquoi et comment la menstruation est apparue au cours de l’évolution.

La première grande découverte de Camille Berthelot a bouleversé les idées reçues : la menstruation est apparue au cours de l'évolution des primates bien plus tôt qu'on ne le pensait. Mieux encore, certaines espèces considérées comme « non menstruantes » présentent en réalité des mécanismes utérins similaires, mais sans les saignements visibles. La menstruation abondante, telle qu’on la connaît chez l’humain, serait donc le résultat de deux étapes évolutives distinctes.

Camille Berthelot ne s’arrête pas à la compréhension fondamentale : elle veut aussi faire avancer la médecine. En analysant des échantillons de sang menstruel avec son équipe, elle a mis en évidence des marqueurs génétiques, permettant de distinguer les femmes atteintes d’endométriose des autres. Sur cinq gènes candidats, quatre ont été identifiés comme biomarqueurs potentiels, faisant l’objet d’un dépôt de brevet.

À terme, ces travaux pourraient révolutionner le diagnostic de l’endométriose, une maladie encore trop souvent détectée tardivement et source d’errance médicale.
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G5 Diversité moléculaire des microbes
Aude Bernheim explore notre « immunité ancestrale » et les mécanismes de défense des bactéries
Aude Bernheim et son équipe ont mis en évidence que notre immunité est aujourd’hui encore façonnée par des mécanismes nés chez les bactéries, il y a des milliards d’années. Une avancée majeure qui permet d'explorer un nouveau champ de recherche : celui de « l'immunité ancestrale ».

Grâce à ces résultats, les scientifiques ouvrent la voie à des immunothérapies d'un nouveau genre, en particulier contre certaines maladies auto-immunes.
Voir l’interview d’Aude Bernheim.
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G5 Interactions microbiote-hôte
Benoit Chassaing traque les effets invisibles, mais profonds, des additifs alimentaires sur notre santé
Benoit Chassaing et son équipe ont montré que les additifs alimentaires peuvent avoir des conséquences très néfastes sur notre microbiote, contribuant ainsi au développement de nombreuses maladies : obésité, diabète, pathologies inflammatoires chroniques de l’intestin, voire même certaines pathologies cardiovasculaires.

En 2026, le chercheur a franchi une nouvelle étape avec la création à l'Institut Pasteur du Programme intégratif sur le microbiome dont il assure la coordination. Son objectif est de générer de nouvelles collaborations scientifiques et d’accélérer le développement de nouvelles approches thérapeutiques.
Voir l’interview de Benoit Chassaing
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G5 Biologie des ARN des parasites
Sebastian Baumgarten explore une piste inédite pour lutter contre le paludisme
Sébastien Baumgarten et son équipe s’intéressent au Plasmodium falciparum, parasite responsable du paludisme qui touche près de 250 millions de personnes chaque année dans le monde. Avec son équipe, il explore une piste inédite basée sur un « gene drive », une technique de génie génétique le plus souvent utilisée pour lutter contre les insectes vecteurs de maladies infectieuses.

Le parasite Plasmodium falciparum a un gène très spécifique, activé seulement en cas de grossesse, et qui infecte le placenta. Des complications majeures surviennent en général. Sans ce gène, le parasite peut toujours infecter une femme enceinte, mais pas le placenta. En outre, indépendamment d’une grossesse, ce gène rend le système immunitaire inefficace en cas d’infection. Sans lui, une personne peut éliminer le parasite du paludisme et développer une immunité beaucoup plus vite contre la maladie : l’effet est similaire à un vaccin atténué.

L'idée serait donc de remplacer tous les parasites Plasmodium falciparum d’une région donnée par des parasites modifiés, qui seraient capables de protéger les femmes enceintes et d’agir comme un vaccin contre le paludisme.
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Nicolás Rascovan analyse les dynamiques épidémiologiques à travers les siècles
Des révélations inédites sur la lèpre
Nicolás Rascovan et son équipe ont contrecarré l’idée que les Européens avaient introduit la lèpre en Amérique. En analysant plus de 800 échantillons d’ADN anciens et modernes, ils ont démontré qu’une autre bactérie responsable de la maladie, Mycobacterium lepromatosis, circulait déjà chez les populations autochtones il y a plus de 1 000 ans.
Deux pathogènes insoupçonnés lors des campagnes napoléoniennes
L’équipe de Nicolás Rascovan a analysé l’ADN extrait des dents de treize soldats de la Grande Armée, exhumés à Vilnius. Les chercheurs ont identifié deux bactéries jusqu’ici peu soupçonnées dans la débâcle de 1812 et qui pourraient avoir aggravé l’état de soldats souvent déjà très affaiblis par le froid, la faim et d’autres maladies. Cette étude suggère ainsi qu’une diversité de maladies infectieuses a probablement contribué à l’effondrement de la campagne napoléonienne.
Tuberculose précolombienne et crises andines
En combinant génomes humains anciens, isotopes, archéologie, données paléoclimatiques et ADN microbien, Nicolás Rascovan et ses collaborateurs ont étudié l’impact des transformations sociales anciennes dans les Andes du Sud. Leur travail montre que, plusieurs siècles après l’adoption locale de l’agriculture, des populations fortement dépendantes du maïs ont connu un déclin démographique prolongé, marqué par des indices de stress nutritionnel, d’infections et de fragilité sanitaire. La détection génomique de la tuberculose chez un individu « pré contact » étend vers le sud l'aire connue de cette maladie en Amérique ancienne et éclaire les liens entre environnement, économie, mobilité et santé humaine.
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Comment ne pas tomber malade ?
Pr Gérard Eberl, des mots pour combattre les maux !
Professeur d’Immunologie et responsable de l’unité Microenvironnement et immunité à l’Institut Pasteur depuis une vingtaine d’années, Gérard Eberl a commencé sa carrière en tant que responsable d’un G5. Il vient tout juste de publier un essai passionnant « Comment ne pas tomber malade ? » aux éditions Flammarion.

C’est à l’Institut Pasteur que Gérard Eberl initie sa recherche sur le rôle du microbiote dans le développement et la régulation du système immunitaire. Ses travaux révèlent notamment qu’un microbiote « perturbé » induit une réactivité accrue du système immunitaire qui peut mener à l’apparition d’une maladie inflammatoire.

Gérard Eberl a dirigé le Département d’immunologie de l’Institut Pasteur pendant quelques années. Aujourd’hui à la tête d’une équipe d’une quinzaine de personnes, Il est aussi co-responsable du pilotage de l'axe « Origine des maladies » du plan stratégique Pasteur 2030. Un vaste champ d’étude sur les maladies chroniques non-infectieuses (cancers, allergies, maladies neurodégénératives…) qui mobilise un grand nombre d’unités et de départements scientifiques.

Auteur de plus de 160 articles et de six brevets, Gérard Eberl figure parmi les immunologistes les plus cités depuis dix ans. Il a reçu de nombreux prix pour l’originalité de sa recherche, à la croisée de l’immunologie, de la microbiologie et des neurosciences.
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13
laboratoires G5 actuellement en activité à l’Institut Pasteur
Biologie cellulaire et infection
Thibaut Brunet
Créé en 2021
> Biologie cellulaire évolutive et évolution de la morphogenèse.
Génomes et génétique
Camille Berthelot
Créé en 2021
> Génomique fonctionnelle comparative.
Aude Bernheim
Créé en 2023
> Diversité moléculaire des microbes.
Parasites, insectes vecteurs
Sebastian Baumgarten
Créé en 2023
> Biologie des ARN des parasites.
Immunologie-neuroscience
Aleksandra Deczkowska
Créé en 2021
> Interactions cerveau-immunité.
Morgane Thion
Créé en 2026
> Neuroimmunologie et interactions materno-fœtales.
Microbiologie
Benoit Chassaing
Créé en 2024
> Interactions microbiote-hôte.
Biologie computationnelle
Laura Cantini
Créé en 2023
> Apprentissage automatique pour la génomique intégrative.
Sebastian Duchene
Créé en 2023
> Dynamiques évolutives des maladies infectieuses.
Virologie
Pablo Guardado Calvo
Créé en 2023
> Biologie structurale des maladies infectieuses.
Sarah Merkling
Créé en 2026
> Immunité et infections des insectes
Biologie structurale et chimie
Spyros Lytras
Créé en 2025
> Évolution et conception des antigènes.
Institut de l’audition
Keith Doelling
Créé en 2025
> Perception humaine et artificielle.
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Trois questions à Didier Mazel,
Directeur des carrières et de l'évaluation scientifiques
Où en êtes-vous du dernier appel à can­didatures lancé fin 2025 pour créer de nouveaux laboratoires G5 ?
Nous avons reçu près de 200 dossiers, comme la fois précédente. Un comité scientifique a examiné chacun d'eux avec beaucoup d'attention. De nombreuses candidatures étaient de grande qualité, ce qui montre l’attractivité de notre campus, mais qui rend la sélection difficile. Huit candidatures au final ont été présentées à notre Conseil scientifique. La dernière étape est maintenant terminée, et si nous avons bien les ressources suffisantes, notre objec­tif est cette année de créer trois nouveaux laboratoires G5 qui s’installeront sur notre campus en 2027.
Les G5 sont créés pour une durée de cinq ans, que se passe-t-il après ?
L’étape cruciale pour les responsables des laboratoires G5 qui arrivent en fin de mandat est l’évaluation scientifique par les pairs. C’est un processus long et rigoureux : ils doivent préparer leur dos­sier d’évaluation six mois avant. Celui-ci est ensuite étudié par dix experts scien­tifiques extérieurs à l’Institut Pasteur et seize personnalités scientifiques basées hors de France.

À noter qu’au moment de leur évaluation, la ma­jorité des responsables de G5 déposent une demande pour transformer leur la­boratoire G5 en unité de recherche pérenne. Car c’est la vocation même de l’initiative G5 : être un incubateur pour des scienti­fiques très talentueux qui deviendront les grands scientifiques de demain.
Quels sont les principaux critères d’évaluation ?
Il y en a plusieurs, mais je dirais avant tout : l’excellence scientifique, un management bienveillant, surtout à l’égard des plus jeunes, doctorants et post-doc­torants, et une vision de leurs recherches sur le long terme : quelle est l’ambition ? Quelles sont les perspectives ?

Le potentiel de développement des projets et leur pérennité sur le long terme restent des éléments clefs de l'évaluation. C'est ce qui nous guide aussi au moment de sélection des futurs responsables d'équipes G5.

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