Depuis sa création, l'Institut Pasteur est à l'avant-garde du combat contre les maladies infectieuses et la
compréhension de la biologie des micro-organismes. Fidèles à l'esprit visionnaire de Louis Pasteur, des équipes
lancent un projet qui vise une avancée scientifique majeure : la création de jumeaux numériques de bactéries
pathogènes.
Equipe du projet Ágnes
Le projet EXPLORE “Ágnes” s'appuie sur un écosystème pasteurien unique réunissant plusieurs équipes de renommée
internationale. Il réunit des savoir-faire inégalés dans les outils de criblage à haut débit, la modélisation des
génomes bactériens et des systèmes biologiques et la bio-informatique.
Les chercheurs ont pour objectif de développer des modèles d’intelligence artificielle multimodaux et de mener des
expérimentations in silico pour répondre à des questions cruciales : que se passera-t-il si cette bactérie
rencontre
tel antibiotique ? Comment cette mutation affectera-t-elle sa capacité à se propager ? Quel est le talon d'Achille
de ce nouveau pathogène émergent ?
Les équipes engagées dans le projet et leurs
axes de recherche
Dr Gregory Batt
Directeur du département de Biologie computationnelle et responsable de l'unité InBio -
Méthodes expérimentales et computationnelles pour la modélisation des processus cellulaires
Dr Aude Bernheim
Responsable du groupe à 5 ans, unité diversité moléculaire des microbes, département de
Santé
globale
Dr David Bikard
Responsable de l'unité Biologie de synthèse, département de Microbiologie
Dr Rayan Chikhi
Responsable de l'unité Algorithmes pour les séquences biologiques, département de Biologie
computationnelle
Dr Laurent Essioux
coordinateur de projet
Directeur du Centre de ressources et de recherches en informatique (C2RI) et du Hub
Bioinformatique et biostatistique, département de Biologie computationnelle